Über die Herkunft des Markennamens prallen zwei Theorien aufeinander. Einige vermuten, dass es aus dem Dorf San Juan in Vuelta Abajo stammt. Andere sagen, dass der Name von dem 1927 in den USA veröffentlichten Roman The Bridge of San Luis Rey inspiriert wurde. Tatsächlich wurde die Marke 1938 von zwei englischen Importeuren (Keyser & Silverstone) registriert. 1960 erhielt Silverstone von den kubanischen Behörden einen Verlängerungsvertrag, der ihm die Rechte zum Vertrieb der Marke für einen Zeitraum von 30 Jahren bis 1990 einräumte. Zwischenzeitlich gab es insbesondere in Deutschland eine von Habanos vertriebene Marke unter dem Namen von San Luis Rey, die im Jahr 2000 verschwand. Heute wird Saint Luis Rey daher weltweit von Habanos vertrieben. Die Vitolas der Marke Saint Luis Rey sind im Allgemeinen vollmundig.